1. 2008年9月，主编教材《商业银行管理》（与周好文联合主编），北京大学出版社出版。
2. 2008年6月，编著教材《银行管理学》，清华大学出版社出版。
3. 2005年1月，改编英文版教材《银行管理学》由高等教育出版社出版。
4. 2003年8月，译著《个人理财计划(第六版)》(与何永晨合译)由中国财政经济出版社出版。
5. 2003年3月，专著《商业银行的边界：经济功能与制度成本》由中国金融出版社出版。
6. 2001年10月，教材《国际投资学》（联合主编）由中国金融出版社出版。
7. 2000年1月，译著《大银行家》（原著：马丁·迈耶）由海南出版社出版。
   

1. 何自云，超越合规，《中国金融》，2008年6月第12期。
2. 何自云，超越责任，《中国金融》，2008年2月第3期。
3. 何自云，“快乐”的银行，《中国金融》，2007年11月第22期。
4. 何自云，“哇！”：银行服务的最高境界，《中国金融》，2007年7月第14期。
5. 何自云，藏富、不信任与私人银行，《中国金融》，2007年5月第9期。
6. 何自云，规则文化与银行治理的有效性，《中国金融》，2007年3月第6期。
7. 何自云，银行：“适当的关系就是一切”，《中国金融》，2007年1月第2期。
8. 何自云，商业银行的生态位与核心竞争力，《农村金融研究》，2003第8期。

1. 何自云，自助天助：打造评级机构眼中的好银行，《当代金融家》，2008年9月第9期。
2. 何自云，提高潜力：打造投资者眼中的好银行，《当代金融家》，2008年8月第8期。
3. 何自云，获取利润：打造管理者眼中的好银行，《当代金融家》，2008年7月第7期。
4. 何自云，以人为本：打造员工眼中的好银行，《当代金融家》，2008年6月第6期。
5. 何自云，风险为本：打造监管当局眼中的好银行，《当代金融家》，2008年5月第5期。
6. 何自云，超越期望：打造客户眼中的好银行，《当代金融家》，2008年3月第3期。
7. 何自云，中美商业银行的利差究竟谁高？《当代金融家》，2008年2月第2期。
8. 何自云，交通银行利润解构及提升策略，《当代金融家》，2008年4月第4期。
9. 何自云，美国商业银行的业务结构：历程与现状，《农村金融研究》，2006第10期。
10. 何自云，信任：财富管理的核心，《农村金融研究》，2006第2期。
11. 何自云，规则文化：外资入股后银行治理的关键，《农村金融研究》，2006第6期。
12. 何自云，关系：银行综合化经营核心，《农村金融研究》，2006第7期。
13. 何自云，风险定价、中国文化与金融稳定，《中国金融》，2006年11月第22期
14. 何自云、马骏，全面开放后对外资银行的监管，《农村金融研究》，2006年第12期。
15. 何自云、金晶，全球银行大比拼——2006年度全球千家大银行排名述评，《农村金融研究》，2006第10期。
16. 何自云，流动性过剩的根源，《农村金融研究》，2005第12期。
17. 吴军、何自云，金融制度的激励功能与激励相容度标准，《金融研究》，2005第6期。
18. 何自云、师敏，英雄末路——美国第七大银行的破产重组，《农村金融研究》，2005第6期。
19. 何自云，风险管理：商业银行的核心能力，《农村金融研究》，2002第10期。
20. 何自云，商业银行的核心功能：管理金融风险——兼论商业银行的未来，《财经科学》，2002第5期。
21. 何自云，市场约束的加强与我国商业银行的对策，《农村金融研究》，2000第1期。
22. 何自云，我国商业银行市场营销的激励机制探析，《农村金融研究》，2002第9期。
23. 崔佳颖、何自云，“一份账单”加“一张支票”，《农村金融研究》，2002第3期。
24. 何自云，西方商业银行中间业务管理的创新与借鉴，《新金融》，2000第5期。
25. 何自云，西方商业银行贷款管理的创新与借鉴，《新金融》，2000第4期。
26. 何自云，西方商业银行借入款管理的创新与借鉴，《新金融》，2000第3期。
27. 何自云，西方商业银行存款管理的创新与借鉴，《新金融》，2000第2期。
28. 何自云，西方商业银行资本管理的创新与借鉴，《新金融》，2000第1期。
29. 何自云，洞察银行业的未来，《经济导刊》，2000第3期。
30. 何自云，加入WTO后中国商业银行业务战略的调整，《中国金融》，2000第2期。